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Cell覆盖的主要是生物医学领域。
不少关于Covid的研究
Tackling COVID-19 with neutralizing monoclonal antibodies
用中和单克隆抗体应对 COVID-19
第 3086-3108 页
单克隆抗体 (mAb) 彻底改变了多种人类疾病的治疗，包括癌症、自身免疫和炎症，并代表了传染病治疗的新前沿。在过去的 20 年中，创新方法允许从恢复期受试者、人源化小鼠或体外组装的文库中快速分离 mAb并且已经证明 mAb 可以有效对抗新出现的病原体。在过去的一年中，为对抗 2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 开发了前所未有的大量 mAb。从这次大流行中吸取的教训将为开发更多基于 mAb 的其他传染病疗法铺平道路。在这里，我们提供了 SARS-CoV-2 中和 mAb 的概述，包括它们的起源、特异性、结构、抗病毒和免疫作用机制以及对循环变异的抵抗力，以及已批准或晚期的临床试验快照-阶段 mAb 疗法。
Structural insight into SARS-CoV-2 neutralizing antibodies and modulation of syncytia
对 SARS-CoV-2 中和抗体和合胞体调节的结构洞察
第 3192-3204.e16 页
严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 的感染是通过病毒 Spike 蛋白与宿主受体血管紧张素转换酶 2 (ACE2) 结合，然后是病毒和宿主膜的融合而引发的。尽管阻断这种相互作用的抗体被紧急用作 2019 年早期冠状病毒病 (COVID-19) 疗法，但中和效力的确切决定因素仍然未知。我们发现了一系列抗体，它们可以有效阻断 ACE2 结合，但对活病毒表现出不同的中和功效。引人注目的是，这些中和抗体可以抑制或增强 Spike 介导的膜融合和合胞体的形成，这与 COVID-19 患者的慢性组织损伤有关。正如冷冻电子显微镜所揭示的那样，Spike-抗体复合物的多种结构具有不同的结合模式，不仅可以阻断 ACE2 结合，还可以改变由 ACE2 结合触发的 Spike 蛋白构象循环。我们表明，不同 Spike 构象的稳定导致 Spike 介导的膜融合的调节，对 COVID-19 病理学和免疫具有深远的影响。
B cell genomics behind cross-neutralization of SARS-CoV-2 variants and SARS-CoV
SARS-CoV-2 变异体和 SARS-CoV 交叉中和背后的 B 细胞基因组学
第 3205-3221.e24 页
单克隆抗体 (mAb) 是对抗严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 及其变体的疫苗和治疗设计的重点。在这里，我们将 B 细胞分选与单细胞 VDJ 和 RNA 测序（RNA-seq）和 mAb 结构相结合，以表征 B 细胞对 SARS-CoV-2 的反应。我们表明，SARS-CoV-2 特异性 B 细胞库由转录不同的 B 细胞群组成，细胞产生强效中和抗体 (nAb)，这些抗体位于类似于记忆和活化 B 细胞的两个簇中。从这两个簇中选择的与 SARS-CoV-2 刺突三聚体复合的 nAb 的冷冻电子显微镜结构显示出对各种受体结合域 (RBD) 表位的识别。这些 mAb 之一，BG10-19，将刺突三聚体锁定在封闭构象中，以有效中和 SARS-CoV-2、最近出现的突变体 B.1.1.7 和 B.1.351 以及 SARS-CoV，并与异源 RBD 发生交叉反应。总之，我们的结果表征了 SARS-CoV-2 特异性 B 细胞之间的转录差异，并揭示了交叉中和抗体靶点，这些靶点将为针对冠状病毒的免疫原和治疗设计提供信息。
研究方法和资源文章
断层扫描这篇是国人的文章，清华大学的
Iterative tomography with digital adaptive optics permits hour-long intravital observation of 3D subcellular dynamics at millisecond scale
具有数字自适应光学的迭代断层扫描允许以毫秒为单位对 3D 亚细胞动力学进行长达一小时的活体观察
第 3318-3332.e17 页
哺乳动物的长期亚细胞活体成像对于研究天然生理过程中的多种细胞间行为和细胞器功能至关重要。然而，光学异质性、组织不透明性和光毒性带来了巨大的挑战。在这里，我们提出了一种计算成像框架，称为数字自适应光学扫描光场互迭代断层扫描 (DAOSLIMIT)，具有高速、高分辨率 3D 成像、平铺波前校正和低光毒性以及紧凑系统的特点。通过同时对整个体积进行断层成像，我们获得了 225 × 225 × 16 μm 3 的体积成像，横向分辨率高达 220 nm，轴向分辨率高达 400 nm，毫秒级，超过数十万个时间点。为了建立这些能力，我们研究了不同物种的大规模细胞迁移和神经活动，并观察了哺乳动物在中性粒细胞迁移和肿瘤细胞循环过程中的各种亚细胞动力学。
Charting human development using a multi-endodermal organ atlas and organoid models
使用多内胚层器官图谱和类器官模型绘制人类发育图
第 3281-3298.e22 页
器官由多种细胞类型组成，这些细胞类型在器官发生过程中会经历短暂的状态。为了探究人类发育过程中的这种多样性，我们从呼吸道和胃肠道的多个发育中的内胚层器官生成了一个单细胞转录组图谱。我们阐明了跨谱系的细胞状态、转录因子以及器官特异性上皮干细胞和间充质相互作用。我们将图集作为一个高维搜索空间，在多种培养条件下对人类多能干细胞 (hPSC) 衍生的肠道类器官 (HIO) 进行基准测试。我们展示了 HIO 概括了参考细胞状态并使用 HIO 来重建肠上皮和间充质出现的分子动力学。我们表明间充质衍生的生态位线索 NRG1 促进肠道干细胞成熟在体外，同源盒转录因子 CDX2 是人类肠道上皮和间充质区域化所必需的。这项工作结合了细胞图谱和类器官技术，以了解人体器官发育是如何协调的。
部分生物体机制研究的文章
The PP2A-Integrator-CDK9 axis fine-tunes transcription and can be targeted therapeutically in cancer
PP2A-Integrator-CDK9 轴可微调转录并可在癌症治疗中靶向
第 3143-3162.e32 页
RNA 聚合酶 II (RNAPII) 的基因表达在转录周期中的离散检查点受到细胞周期蛋白依赖性激酶 (CDK) 的严格控制。转录起始后的暂停检查点主要由 CDK9 控制。我们发现 CDK9 介导的、RNAPII 驱动的转录在功能上受到蛋白磷酸酶 2A (PP2A) 复合物的阻碍，该复合物被 Integrator 复合物亚基 INTS6 募集到转录位点。PP2A 动态拮抗包括 DSIF 和 RNAPII-CTD 在内的关键 CDK9 底物的磷酸化。INTS6 的缺失导致对 CDK9 抑制介导的肿瘤细胞死亡的抵抗、CDK9 磷酸化底物的周转减少和急性致癌转录反应的放大。体内。这些数据表明，基因表达的精细控制依赖于整个转录周期中激酶和磷酸酶活性之间的平衡，这是癌症中失调的过程，可以在疗上加以利用。
Splice site m6A methylation prevents binding of U2AF35 to inhibit RNA splicing
剪接位点 m 6 A 甲基化阻止 U2AF35 结合以抑制 RNA 剪接
第 3125-3142.e25 页
所述Ñ 6 -methyladenosine（M 6 A）RNA修改被广泛用于改变mRNA的命运。在这里，我们证明了秀丽隐杆线虫作者 METT-10（小鼠 METTL16 的直系同源物）在 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 合成酶前体 mRNA 的 3' 剪接位点 (AG) 上沉积了一个 m 6 A 标记，从而抑制了其适当的剪接和蛋白质生产。该机制由丰富的饮食触发，并作为 m 6 A 介导的开关来阻止 SAM 产生并调节其体内平衡。虽然哺乳动物 SAM 合成酶前体 mRNA 不受这种机制的调节，但我们表明 3' 剪接位点 m 6 的剪接抑制A在哺乳动物中是保守的。修饰通过物理阻止基本剪接因子 U2AF35 识别 3' 剪接位点来发挥作用。我们建议使用剪接位点 m 6 A 是一种古老的剪接调节机制。
Small RNAs are modified with N-glycans and displayed on the surface of living cells
小 RNA 用 N-聚糖修饰并展示在活细胞表面
第 3109-3124.e22 页
聚糖修饰脂质和蛋白质，以介导生命各个领域的分子间和分子内相互作用。RNA 不被认为是糖基化的主要目标。在这里，我们用哺乳动物使用 RNA 作为糖基化的第三个支架的证据来挑战这一观点。使用一系列化学和生化方法，我们发现保守的小非编码 RNA 带有唾液酸化聚糖。这些“glycoRNAs”存在于多种细胞类型和哺乳动物物种、培养细胞和体内. GlycoRNA 组装依赖于经典的 N-聚糖生物合成机制，并导致富含唾液酸和岩藻糖的结构。活细胞分析表明，大多数 glycoRNA 存在于细胞表面，并且可以与抗 dsRNA 抗体和 Siglec 受体家族的成员相互作用。总的来说，这些发现表明 RNA 生物学和糖生物学之间存在直接的联系，以及 RNA 在细胞外生物学中的扩展作用。
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发表于 2021-6-15 21:35:36
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